Ο Tομέας Γλωσσολογίας του Ινστιτούτου Μεσογειακών Σπουδών είναι η μοναδική ερευνητική δομή στην Ελλάδα που έχει ως αντικείμενο την έρευνα της ιστορικής εξέλιξης των γλωσσών με τη χρήση μεθόδων εμπνευσμένων από την εξελικτική βιολογία. Διερευνά τα μοντέλα που είναι κατάλληλα για να αναπαραστήσουν τις ιστορικές και γεωγραφικές σχέσεις μεταξύ των γλωσσών, καθώς και τα είδη των γλωσσικών δεδομένων που είναι καταλληλότερα για την επανασύνθεση του γλωσσικού παρελθόντος. Αποτελεί πεδίο συνάντησης ανάμεσα στη γλωσσολογία, την εξελικτική βιολογία και την πληροφορική και συνδυάζει τη θεωρητική-τυπική γλωσσολογία με την ιστορική γλωσσολογία, τη διαλεκτολογία και την τυπολογία. Εστιάζει σε γλωσσικά δεδομένα από τη μορφολογία και τη σύνταξη των γλωσσών, σε σύγκριση με τα ως τώρα ευρέως χρησιμοποιούμενα λεξικά/ετυμολογικά δεδομένα.
Ο Τομέας ιδρύθηκε το 2023 και λειτουργεί ως ένας συνδετικός κρίκος ανάμεσα στις ανθρωπιστικές επιστήμες, τις επιστήμες της ζωής και την επιστήμη των υπολογιστών. Στοχεύει στη δημιουργία των προϋποθέσεων ώστε να αναπτυχθεί ένας διεπιστημονικός χώρος που αναπτύσσεται ταχύτατα στο εξωτερικό και απουσιάζει από την Ελλάδα. Για την επίτευξη των στόχων του, ο Tομέας θα αναπτύξει πρωτοπόρες δομές για την εκπαίδευση νέων επιστημόνων και την παραγωγή ερευνητικού έργου που θα συνδυάζει ποιοτικές και ποσοτικές μεθόδους ώστε α) να αναδείξει τις ιδιαιτερότητες της εξέλιξης των γλωσσών σε σχέση με την εξέλιξη των ειδών και β) να αποτιμήσει την πληροφορία που εμπεριέχουν τα γλωσσικά δεδομένα. Σε συνεργασία με βιολόγους, επιστήμονες των υπολογιστών, και πιθανές μελλοντικές συνέργειες με ιστορικούς, αρχαιολόγους, φιλολόγους και ανθρωπολόγους, ο Τομέας θα συμβάλει στην ανακατασκευή της γλωσσικής ιστορίας, φωτίζοντας όψεις της καταγωγής και ιστορίας του ανθρώπου με έμφαση στους πληθυσμούς της Ευρασίας, της Μεσογείου και της Ελλάδας.